孔明之兄，东吴大臣诸葛瑾墓也在明朝时被盗 。这一事实见于《三冈识略》一书 。书中写道：吴郡的东关外有封土堆，当地人都传其为皇坟 。明朝时有一猎户到关外打猎，见到土堆旁有一个孔穴 。于是当夜便潜了进去 。进去后，他发现里面有石床石几，上面堆满了金银器物 。最奇的是里面有一宝炉，形状古朴，色彩鲜艳 。这只宝炉后来几经转手，被当地一富豪购得 。富豪将其置于案上，只见炉内香烟自发，结成五色云，更奇的是，在云中还能隐隐约约看到一只白鹤在其间飞翔 。墓中有一短碑，其上刻的文字表明墓的主人是诸葛瑾 。后来吴郡的官府抓获猎户，将宝物全部没收 。但那只宝炉却散失于民间，下落不明 。
东晋大臣桓温之墓，在南朝时被掘 。据《南史·周山图传》记载：“山图迁淮南太守 。时盗发桓温冢，大获宝物 。客窃取小遗山图，山图不受，簿以为官 。”其后，桓温之女的墓葬也被盗发，盗墓贼“得金中箱织金篾为严器，又有金蚕银玺等物甚多” 。
南北朝时陈朝的开国皇帝陈武帝陈霸先之墓曾被盗掘 。
陈霸先，吴兴郡长城县(今浙江长兴县)人，他家世寒贱，不列在士族 。早年当里司、油库吏、传令吏等微职 。后来得小军职，因镇压一起小股农民起义，官位渐显 。梁朝末年，朝内大乱，陈霸先与梁朝另一大将王僧辩在消除内乱、拥立梁元帝方面立下了大功 。梁元帝死后，两人又拥元帝之子萧方智为主 。此时，强大的北齐国派兵护送梁武帝萧道成之侄萧渊明回国，要与萧方智争当梁国国君 。陈霸先坚持维护原主，而王僧辩则畏惧北齐的强大，要迎萧渊明为主 。两人为此争执不下 。于是，在再三劝说无效的情况下，陈霸先突然发兵，袭击王僧辩，并将其杀死 。557年，陈霸先又灭掉梁朝，自立为王，建立陈朝，自称陈武帝 。
陈霸先即位未及三年，便病逝宫中，被葬于建康万安陵 。王僧辩之子王颁得知陈霸先的死讯后，召集其父的旧部千余人，连夜赶到万安陵，掘墓剖棺，焚尸成灰，并且取骨灰投水而饮之，以报杀父之仇 。
陈霸先的万安陵遗址，位于今天的南京市郊江宁县上坊乡石马冲 。陵的原貌早已荡然无存，只有陵前的一对石兽经历风雨沧桑，昂然屹立 。
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