1.紫外线诱导碱基突变的机制是怎样的紫外线的致突变作用 紫外线(ultraviolet light,UV)能使DNA产生很多光生成物 。有两种不同的光生成物 , 一种发生在相邻的两个嘧啶之间——环丁烷嘧啶光二聚体 , 另一种是6-4光生成物 。其中胸腺嘧啶二聚体是重要的一种损伤 。
实验证明 , 经UV照射的胸腺嘧啶溶液的吸收光谱与原来不一样 。说明它的结构已发生变化 。经分析测定 , 它们已变成胸腺嘧啶二聚体 。当UV照射后 , 先是两个胸腺嘧啶的双链变成单链 , 然后两个胸腺嘧啶分子连接起来 , 形成一个胸腺嘧啶二聚体 。
胸腺嘧啶二聚体通常发生在同一DNA链上两个相邻的胸腺嘧啶之间 , 也可以发生在两个单链之间 , 这种二聚体是很稳定的 。如果它发生在两链之间 , 就会由于它的交联而阻碍双链的分开 , 从而影响复制;如果它发生在同一链的两个相邻胸腺嘧啶之间 , 就会阻碍腺嘌呤A的正常掺入作用 , 复制时就会在此处突然停止 , 并随意掺入别的碱基 , 结果在新合成的链上的碱基顺序发生了改变 , 因而引起突变 。紫外线引起的突变包括各种形式的转换和颠换 。
【碱基突变怎么写】在二聚体的3'端插入一个错误碱基 , 通常的二聚体为5'-CC-3'和5'-TC-3' , 所以C→T转换最为常见 。
紫外线还能引起缺失、重复和移码突变 。这些突变可能是紫外线的直接作用、间接作用和SOS系统共同作用的结果 。
SOS修复系统有诱变作用 。当E.coli中的RecA蛋白发生改变时 , 能使细菌细胞出现SOS反应 , 同时也发生各种转换和颠换 , 但以G-C→T-A颠换为多 , 而且有序列优先性 , 如在CGA序列中的G→T颠换率是在AGA或GGA序列中的20倍以上 。已知在E.coli中SOS系统的诱变作用除了与recA有十分重要关系外 , 与umnC、umuD基因的关系也十分密切 。umuC突变使SOS系统的诱变作用丧失 , 因此umnC基因产物很可能是错误潜伏修复系统的重要组成部分 。SOS系统的诱变作用的另一种可能途径是RecA蛋白促进了不完全同源的DNA序列之间的重组 , 产生大量的错配碱基 , 从而引起突变 。
2.请问,用perl语言如何将DNA序列中的任意碱基突变,随机产生20条突我先给你说个原理 , 首先读取序列 , 以$seq为例 , 然后取int rand(length($seq))即是你要突变的随机位点号;然后可以随机取$mutation=int rand(4);这里要看你的具体处理情况了 , 你是容忍A突变成A呢 , 还是必须选一个不一样的来突变 。如果必须不一样的话 , 你也可以选int rand(3) , 这样取的是0,1,2 , 然后分别对应另外3个碱基 。这样的突变是等概率的 , 你也可以根据自己的原理来修改 。
至于怎么由随机数生成碱基 , 可以写个函数 , 然后用if完成 , 这是最简单的方法了 。
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